阪泉之战后，另一方势力也飞速崛起，那就是以蚩尤为首的九黎族势力。蚩尤乃是九黎族的首领，骁勇善战，之前曾和炎帝同属一个部落，颇有渊源。也有人说蚩尤是炎帝的后人，但真相如何，早已无从考证。不过九黎族的牛图腾和炎帝部落的牛图腾本是同根同源，所以，稗官野史也未必是空穴来风。蚩尤也是牛图腾氏族和鸟图腾氏族的首领，也正因为如此，荆奕才在大殿前看到蚩尤铜像和窗棂上雕刻的黄雀之时便猜出了仡侨长勤的身份。
蚩尤魔尊共有八十一名兄弟，他们也是八十一个氏族的首领，各个身怀绝技，本领非凡。蚩尤魔尊面如牛首，背生双翅，他兴农耕、冶铜铁、制五兵、创百艺、明天道、理教化。如果说黄帝是华夏第一代英雄的话，那么华夏第一枭雄非蚩尤莫属。相传蚩尤魔尊有八只脚，三头六臂，铜头铁额，刀枪不入。善于使用刀、斧、戈作战，不死不休，勇猛无比。就连黄帝也不能力敌，所以只好请天神相助。正因为如此，蚩尤魔尊也被称为华夏的兵主和战神。
随着时间的流逝，两位华夏大陆上顶尖的强者终于爆发了一场意料之中的战争。蚩尤魔尊制造五兵之器，变化出云雾，在涿鹿弥漫，三日不散。最终，黄帝依靠北斗七星的位置才辨别了方位，创造出指南车，逃出云雾。黄帝虽然精通谋略，但是在修为上却不敌蚩尤魔尊。二人之间的旷世之战打了许多年，黄帝曾有过三年攻不下对方一座城池的战绩，二人交锋之时，黄帝更是九战九不胜。后来，黄帝在梦中得到九天玄女的帮助，九天玄女传给黄帝兵信神符，又告知击败蚩尤的办法。黄帝醒来之后，按照九天玄女所说，于东海上的一座山中捕获了数十头夔牛，将其皮制成鼓面，又以雷兽的骨制成鼓槌。槌鼓相击之下，声震九州，正是有了这八十面鼓的相助，炎黄部落的人们士气大振，在应龙和女魃的帮助之下，终于击败了蚩尤魔尊。